terça-feira, 12 de fevereiro de 2019

O Fortran é uma linguagem de programação muito usada pelos químicos para resolver problemas complexos. Os programas elaborados em Fortran têm de ser compilados para que o computador os possa "entender" ao serem executados. Em termos simples podemos dizer que a compilação é o equivalente à tradução na linguagem humana: compilador "traduz" o código fortran para a linguagem (binária) da máquina. Existe uma versão do compilador gfortran para Windows que pode ser obtido aqui. A instalação e o modo de utilização deste compilador são explicados no vídeo seguinte.


sexta-feira, 8 de fevereiro de 2019

O wxmacmolplt é um programa que permite visualizar estruturas moleculares, lendo a respetiva informação em formato XYZ. Permite ainda, de forma muito simples, construir a estrutura molecular a partir do zero. A qualidade gráfica da representação é bastante bem conseguida.
Este é um programa com licença GPL (General Public Licence), ou seja, trata-se de software livre que pode ser executado, partilhado e modificado. Existem versões para várias plataformas (Linux, Windows e Mac OS X) que podem ser obtidas aqui.
Elaborámos um pequeno vídeo para principiantes do wxmacmolplt:


sexta-feira, 11 de outubro de 2013

Prémio Nobel da Química 2013

Depois do Nobel da Química em 1998 atribuído a Walter Kohn (1923-) and John Pople (1925-2004), devido às suas contribuições no desenvolvimento de métodos quânticos que permitem o estudo teórico de sistemas químicos, o comité Nobel resolveu atribuir o prémio de 2013 mais uma vez na área da Química Computacional. Foram desta vez galardoados Martin Karplus (Universidade de Estrasburgo e Universidade de Harvard), Michael Levitt (Universidade de Stanford) e Arieh Warshel (Universidade do Sul da Califórnia), pelo "desenvolvimento de modelos multi-escala para sistemas químicos complexos". Os laureados desenvolveram modelos computacionais que permitem simular sistemas químicos e, em particular, sistemas moleculares complexos in silico. Deste modo, é possível estudar com um nível de detalhe molecular sistemas tão complexos como proteínas. Os trabalhos seminais destes cientistas possibilitaram criar um novo paradigma na investigação em Química, isto é, uma via alternativa à experimentação em laboratório e à aplicação da teoria. Entrámos assim na era da simulação computacional e da modelação molecular!

quinta-feira, 4 de julho de 2013