Depois do Nobel da Química em 1998 atribuído a Walter Kohn (1923-) and John Pople (1925-2004), devido às suas contribuições no desenvolvimento de métodos quânticos que permitem o estudo teórico de sistemas químicos, o comité Nobel resolveu atribuir o prémio de 2013 mais uma vez na área da Química Computacional. Foram desta vez galardoados Martin Karplus (Universidade de Estrasburgo e Universidade de Harvard), Michael Levitt (Universidade de Stanford) e Arieh Warshel (Universidade do Sul da Califórnia), pelo "desenvolvimento de modelos multi-escala para sistemas químicos complexos". Os laureados desenvolveram modelos computacionais que permitem simular sistemas químicos e, em particular, sistemas moleculares complexos in silico. Deste modo, é possível estudar com um nível de detalhe molecular sistemas tão complexos como proteínas. Os trabalhos seminais destes cientistas possibilitaram criar um novo paradigma na investigação em Química, isto é, uma via alternativa à experimentação em laboratório e à aplicação da teoria. Entrámos assim na era da simulação computacional e da modelação molecular!
sexta-feira, 11 de outubro de 2013
Prémio Nobel da Química 2013
Depois do Nobel da Química em 1998 atribuído a Walter Kohn (1923-) and John Pople (1925-2004), devido às suas contribuições no desenvolvimento de métodos quânticos que permitem o estudo teórico de sistemas químicos, o comité Nobel resolveu atribuir o prémio de 2013 mais uma vez na área da Química Computacional. Foram desta vez galardoados Martin Karplus (Universidade de Estrasburgo e Universidade de Harvard), Michael Levitt (Universidade de Stanford) e Arieh Warshel (Universidade do Sul da Califórnia), pelo "desenvolvimento de modelos multi-escala para sistemas químicos complexos". Os laureados desenvolveram modelos computacionais que permitem simular sistemas químicos e, em particular, sistemas moleculares complexos in silico. Deste modo, é possível estudar com um nível de detalhe molecular sistemas tão complexos como proteínas. Os trabalhos seminais destes cientistas possibilitaram criar um novo paradigma na investigação em Química, isto é, uma via alternativa à experimentação em laboratório e à aplicação da teoria. Entrámos assim na era da simulação computacional e da modelação molecular!
quinta-feira, 4 de julho de 2013
Raio atómico
Efectuámos o cálculo de estrutura electrónica para o Néon, o Árgon e o Crípton. Representámos e comprámos as respectivas orbitais p mais externas:
Esta imagem permite visualizar o aumento do raio atómico ao longo do grupo 18 da Tabela Periódica.
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| Orbitais p mais externas do Néon, Árgon e Crípton. |
Esta imagem permite visualizar o aumento do raio atómico ao longo do grupo 18 da Tabela Periódica.
Orbitais Atómicas
Realizámos o cálculo de estrutura electrónica para um ião de Molibdénio (Mo2+) e obtivemos as seguintes orbitais:
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| Algumas das orbitais do ião Molibdénio (Mo2+) - Todas as representações se encontram à mesma escala. |
quarta-feira, 3 de julho de 2013
Apresentação do estágio
Ao longo da semana de 1 a 5 de Julho, tivemos o prazer de trabalhar no Laboratório de Química Computacional, do Departamento de Química da Faculdade de Ciências e Tecnologias da Universidade de Coimbra, oportunidade garantida em pareceria com o programa "Ciência Viva no Laboratório - Ocupação científica de jovens nas férias".Com este estágio, ficámos a conhecer um pouco melhor a química computacional e os seus diversos objectos e métodos de estudo. Agradecemos, desde já, ao Dr. Jorge Marques e ao Dr. Paulo Abreu pela disponibilidade e paciência.
As actividades que desenvolvemos tinham como objectivo o estudo de orbitais atómicas e moleculares, partindo de um cálculo de estrutura electrónica.
Utilizámos o programa Gamess-US para resolver a equação de Schrödinger e, seguidamente obtivemos as representações das orbitais com o macmolplt.
As actividades que desenvolvemos tinham como objectivo o estudo de orbitais atómicas e moleculares, partindo de um cálculo de estrutura electrónica.
Utilizámos o programa Gamess-US para resolver a equação de Schrödinger e, seguidamente obtivemos as representações das orbitais com o macmolplt.
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| Software macmolplt. |
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| Representação de uma orbital d, obtida em macmolplt. |
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